Содержание

Инобитек DICOM-Просмотрщик

4.3. Совмещение слоёв

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции "Pro"
____________________________________________________________________________________________

Слои объединённой серии не всегда совпадают, особенно в случаях, когда объединены два разных исследования (пример на рис. 4.2). В этом случае выполняется совмещение слоёв.

Для совмещения слоёв выполните следующие действия:

Откройте объединённую серию в окне мультипланарной реконструкции, нажав на кнопку "МПР-реконструкция" на панели инструментов,

В открывшейся вкладке откройте панель сегментации , нажав на кнопку "Панель сегментации" . В нижней части панели сегментации находится панель совмещения слоёв (рис. 4.3).
Выделите слой, который необходимо совместить с базовым. Если выделенный слой имеет одинаковое значение тега "FrameOfReferenceUID" с любым другим, то на панели совмещения слоёв отображается кнопка . Подробнее об объединении слоёв с заблокированной системой координат см. в разделе 4.3.1.
Совместите слои автоматически (раздел 4.3.2), вручную (раздел 4.3.3) или по опорным точкам (раздел 4.3.4).

Рис. 4.2: Несовпадающие после объединения слои

Рис. 4.3: Панель совмещения слоёв

Чтобы свернуть панель совмещения слоёв, нажмите на кнопку "Скрыть" , чтобы развернуть свёрнутую панель — на кнопку "Показать" .

Чтобы настроить параметры режима совмещения, нажмите на кнопку "Параметры" на панели совмещения слоёв. Диалог настройки режима совмещения приведён на рис. 4.4.

Рис. 4.4: Диалоговое окно "Настройка режима совмещения"

4.3.1 Блокировка системы координат слоя

Положение серий одного исследования обычно задано в одной системе координат. Идентификатор системы координат задается DICOM-тегом "FrameOfReferenceUID". Серии с одинаковым значением тега "FrameOfReferenceUID" имеют общую систему координат.

Если выделенный слой имеет общую систему координат с любым другим, то на панели совмещения слоёв отображается кнопка . Для базового (первого) слоя данная кнопка не отображается.

При выполнении операции совмещения слоёв слои с заблокированной системой координат изменяют своё положение синхронно с другими слоями, имеющими общую систему координат. Если слой с заблокированной системой координат имеет общую систему координат с базовым (первым) слоем, то операции совмещения для него недоступны без разблокировки.

Чтобы выполнить совмещение слоёв с общей системой координат друг относительно друга, выполните следующие действия:

Выделите слой, систему координат которого необходимо разблокировать для совмещения. На панели совмещения слоёв отображается кнопка .

Нажмите на кнопку "Разблокировать систему координат слоя" на панели совмещения слоёв. Кнопка слоя с разблокированной системой координат имеет вид .

Выполните совмещение слоёв автоматически (раздел 4.3.2), вручную (раздел 4.3.3) или по опорным точкам (раздел 4.3.4).
При необходимости разблокируйте систему координат других слоёв и выполните совмещение снова.

Разблокировка и блокировка системы координат выполняется для каждого слоя отдельно. Слои с разблокированной системой координат имеют возможность независимого перемещения. Настройка положения слоёв с заблокированной системой координат не влияет на положение слоёв с разблокированной системой координат.

Чтобы вернуть слой к исходной системе координат, нажмите на кнопку "Заблокировать систему координат слоя" на панели совмещения слоёв. При последующей разблокировке положение слоя восстанавливается в положение, в котором слой находился до нажатия кнопки "Заблокировать систему координат слоя" .

Результаты настройки положения слоёв и информация о блокировке сохраняются в проекте сегментации (см. раздел 6.11.1) и при экспорте в DICOM (см. раздел 4.3.5).

4.3.2 Автоматическое совмещение слоёв

Чтобы совместить слои автоматически, выполните следующие действия:

Нажмите на кнопку "Совместить слои автоматически" на панели совмещения слоёв (рис. 4.3). Запустится процесс совмещения, откроется окно "Оптимизация корреляции".
Чтобы отменить совмещение, нажмите "ОТМЕНА" в окне "Оптимизация корреляции".
По завершении совмещения нажмите "ГОТОВО" в окне "Оптимизация корреляции".
Качество совмещения может быть неудовлетворительным, если плотности тканей на совмещаемых слоях сильно отличаются. В этом случае установите флаг "Корреляция градиента" в диалоге настройки режима совмещения (см. раздел 4.3, рис. 4.4) и повторите шаги 1-3.
Чтобы изменить точность совмещения, перемещайте ползунок "Точность автосовмещения" в диалоге настройки режима совмещения (см. раздел 4.3, рис. 4.4) вправо для увеличения точности и влево — для уменьшения. Чем выше точность, тем больше времени занимает процесс.

Чтобы совместить слои по части объёма, выполните следующие действия:

Выберите слой, который необходимо совместить с базовым.
Постройте на этом слое сегментированную структуру, маска которой соответствует объёму, по которому должно выполняться совмещение. Совмещение выполняется именно по маске, а не по построенному объёму сегментированной структуры.
Нажмите на кнопку "Совместить слои автоматически" .

4.3.3 Ручное совмещение слоёв

Чтобы совместить слои вручную, выполните следующие действия:

Нажмите на кнопку "Ручное совмещение серий" левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14.
Совместите изображения в трёх проекциях. Для этого выполните следующие действия:
- удерживая левую кнопку мыши или нажимая клавиши управления курсором , , и , перемещайте выделенный слой;
- удерживая клавишу Alt на клавиатуре и левую кнопку мыши, вращайте выделенный слой;
- удерживая клавишу Ctrl на клавиатуре и левую кнопку мыши, масштабируйте выделенный слой. Масштабирование, как правило, требуется только в том случае, если нарушена калибровка устройства, с помощью которого проводилось исследование.
Чтобы отменить все преобразования, нажмите на кнопку "Сброс всех преобразований" .
Чтобы отменить масштабирование, нажмите на кнопку "Сброс масштабирования".
Чтобы изменить шаг перемещения слоя клавишами управления курсором, задайте нужное значение в поле "Шаг перемещения клавишей" диалога настройки режима совмещения (см. раздел 4.3, рис. 4.4).
Когда слои совмещены до приемлемого уровня, закройте вкладку "МПР-реконструкция". На экране снова отобразится вкладка "Объединение серий".
Пролистайте изображения объединённых серий, чтобы увидеть результат совмещения. Если результат неудовлетворителен, снова выполните совмещение.

4.3.4 Совмещение слоёв по точкам

Чтобы совместить слои по точкам, выполните следующие действия:

Сделайте все слои кроме базового прозрачными. Для этого перемещайте регулятор прозрачности для окон МПР соответствующего слоя влево. Регулятор прозрачности выделен красным цветом на рис. 4.5.
Выделите на панели сегментации базовый слой.
Активируйте инструмент "Установить точки" левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14..

Рис. 4.5: Регулятор прозрачности слоя

Поставьте минимум три опорные точки на изображении. Каждая точка имеет свой цвет и номер.

Выделите слой, который необходимо совместить с базовым. Сделайте все слои кроме этого прозрачными.

Поставьте на этом слое такое же число опорных точек в те же места, в которых стоят точки на базовом слое. Нумерация точек начинается сначала. Цвета точек с одинаковыми номерами совпадают.

При необходимости скорректируйте положения точек на всех трёх проекциях. При наведении курсора на точку она подсвечивается на всех трёх проекциях.

Чтобы удалить точку, наведите на неё курсор, щёлкните правой кнопкой мыши и выберите команду "Удалить точку".

Чтобы перейти к срезам, содержащим точку, наведите на неё курсор, щёлкните правой кнопкой мыши и выберите команду "Перейти к точке". Точка, находящая на текущем срезе, более яркая, чем другие.

Чтобы удалить все точки, нажмите на кнопку "Удалить все точки" на панели совмещения слоёв. В диалоге подтверждения нажмите "ДА", чтобы удалить точки, и "НЕТ" для отмены удаления.

Чтобы изменить диаметр точек, вызовите диалог настройки режима совмещения (см. раздел 4.3, рис. 4.4) и задайте нужное значение диаметра в миллиметрах.
Нажмите на кнопку "Совместить слои по точкам" на панели совмещения слоёв. Второй слой будет перемещён таким образом, чтобы соответствующие точки оказались как можно ближе друг к другу.
При необходимости скорректируйте положения точек и выполните совмещение снова.
При необходимости добавьте одинаковое количество точек на совмещаемые слои.

На рис. 4.6 показан пример расположения опорных точек. Красные точки (№1) расположены на кончике носа, зелёные (№2) — на макушке, синие (№3) — на правом глазу.

Рис. 4.6: Опорные точки

Если точки поставлены правильно, то после совмещения они совпадут с незначительными погрешностями. Если же точки поставлены неточно, то результат совмещения выглядит примерно так, как на рис. 4.7.

Рис. 4.7: Опорные точки совпали с большой погрешностью из-за неточности установки

4.3.5 Экспорт и импорт матриц совмещения слоёв

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в дополнительном модуле, который активируется в редакции "Pro" за отдельную плату
____________________________________________________________________________________________

DICOM-Просмотрщик осуществляет экспорт и импорт матриц совмещения слоёв в DICOM Spatial Registration IOD (модальность REG).

Чтобы экспортировать совмещение серий, нажмите на кнопку "Экспорт совмещения серий в объект DICOM" на панели совмещения слоёв (рис. 4.3).

В открывшемся диалоговом окне "Экспорт в DICOM Registration" (рис. 4.8) добавьте описание экспортируемой серии с совмещением. По умолчанию сохраняется описание "Совмещение серий". Нажмите "OK", чтобы экспортировать серии с совмещением, или "ОТМЕНА" для отмены.

Рис. 4.8: Диалоговое окно "Экспорт в DICOM Registration"

Экспортированное совмещение серий сохраняется в локальное хранилище в виде новой серии с модальностью "REG". Миниатюра новой серии добавляется к текущим на панели серий в исследование, в котором находится базовый слой.

Чтобы импортировать матрицу совмещения слоёв, выполните:

Создайте объединённую серию из серий, для которых был экспортирован объект "DICOM Registration". Обратите внимание на порядок выбора серий. Выделите первый (базовый) слой.

Нажмите на кнопку "Импорт совмещения серий из объекта DICOM" на панели совмещения слоёв (рис. 4.3).
В открывшемся диалоговом окне "Импорт из DICOM Registration" (рис. 4.9) выберите экспортируемую матрицу совмещения. Нажмите "OK", чтобы импортировать матрицу совмещения серии, или "ОМЕНА" для отмены.

Рис. 4.9: Диалоговое окно "Импорт из DICOM Registration"

Слои совмещаются относительно первого (базового) слоя.