Содержание

Инобитек DICOM-Просмотрщик

6.7. Импорт и экспорт

6.7 Импорт и экспорт

6.7.1 Экспорт поверхности

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в редакции «Pro»
____________________________________________________________________________________________

Чтобы настроить параметры экспорта поверхности по умолчанию, нажмите на кнопку «Параметры» на панели сегментрованных структур и выберите пункт «Параметры экспорта/импорта...». В открывшемся диалоговом окне (рис. 6.14) настройте параметры экспорта поверхности по умолчанию:

чтобы переместить опорную точку (точку, относительно которой происходит деформация модели в редакторах векторной графики) в геометрический центр поверхности, установите флаг «Начало координат в центре модели». Флаг по умолчанию снят;
чтобы учесть при экспорте координаты пациента, установите флаг «Использовать координаты пациента при экспорте и импорте поверхности». Флаг установлен по умолчанию.

Нажмите «OK», чтобы применить изменения, или «ОТМЕНА» для отмены.

Рис. 6.14: Диалоговое окно настройки параметров экспорта и импорта поверхности

Чтобы экспортировать поверхность сегментированной структуры, выполните:

На панели сегментированных структур выделите поверхность, которую нужно экспортировать.

Вызовите выпадающее меню с вариантами экспорта одним из двух способов:

нажмите на кнопку «Экспорт» на панели сегментированных структур и в выпадающем меню выберите тип экспорта;
наведите курсор мыши на структуру в списке, щёлкните правой кнопкой мыши, выберите в контекстном меню пункт «Экспорт» и в выпадающем меню выберите тип экспорта.

Доступно три варианта экспорта поверхности:

«Экспорт выделенной поверхности». Экспортируется только текущая выделенная поверхность. Экспорт доступен в файл формата .ply, .obj, .stl или .glb. В открывшемся диалоговом окне выберите тип файла и сохраните поверхность;

«Экспорт видимых поверхностей». Экспортируются все видимые поверхности, для которых включена видимость на панели сегментированных структур. Экспорт доступен только в файл формата .glb;

«Экспорт всех поверхностей». Экспортируются все поверхности из панели сегментированных структур. Экспорт доступен только в файл формата .glb.

Рис. 6.15: Меню экспорта

Если экспорт выполняется для нескольких слоёв, то сохраняется следующая иерархия расположения: на первом уровне располагаются слои (с названием соответствующей им серии), а на втором — поверхности. При экспорте поверхностей с одного слоя сохраняется один уровень иерархии — поверхности.

Для каждой поверхности сохраняется название, цвет вершин и прозрачность. При экспорте нескольких поверхностей сохраняется их взаимное расположение, которое совпадает с взаимным расположением в DICOM-Просмотрщике на момент экспорта.

При печати поверхности на 3D-принтере необходимо учитывать, что поверхность имеет погрешности по следующим причинам:

Точность поверхности зависит от размера вокселя и не может быть выше, чем размер вокселя.
Границы маски структуры, для которой строится поверхность, определяются в том числе цветовой таблицей для исходного объёма. Неправильный выбор цветовой таблицы может сделать невидимыми нужные ткани и, наоборот, сделать видимыми лишние ткани.
Граница между тканями разной плотности достаточно размытая из-за физических основ сканирования тканей. Погрешность может составлять несколько вокселей.
На точность построения поверхности влияет сглаживание и количество треугольников.

6.7.2 Импорт поверхности

Чтобы настроить параметры импорта поверхности по умолчанию, нажмите на кнопку «Параметры» на панели сегментированных структур и выберите пункт «Параметры экспорта/импорта...». В открывшемся диалоговом окне (рис. 6.16) отметьте флагами:

чтобы учесть при импорте координаты пациента, установите флаг «Использовать координаты пациента при экспорте и импорте поверхности». Флаг установлен по умолчанию;
чтобы совместить при импорте центры импортируемой поверхности и модели, установите флаг «Поместить в центр модели». По умолчанию флаг снят;
чтобы при импорте поверхности в формате (stl) объединить вершины треугольников, установите флаг «Объединять вершины при импорте из STL». Флаг установлен по умолчанию.

Нажмите «OK», чтобы применить изменения, или «ОТМЕНА» для отмены.

Рис. 6.16: Диалоговое окно настройки параметров экспорта и импорта поверхности

Импорт поверхностей может быть выполнен двумя способами:

нажмите на кнопку «Импорт поверхности(ей)» , в открывшемся диалоговом окне выберите файлы и нажмите «Открыть»;

наведите курсор мыши на структуру в списке, щёлкните правой кнопкой мыши, выберите в контекстном меню пункт Импорт->Импорт поверхности(ей)... и в открывшемся диалоговом окне выберите файлы и нажмите «Открыть».

Имя импортированной поверхности, как и любой структуры без маски структуры, отображается курсивом. На рис. 6.17 показана импортированная поверхность Surface_example-1. Изменение числа треугольников в импортированной поверхности невозможно.

Чтобы переместить импортированную поверхность вручную, активируйте инструмент «Позиционирование поверхности» на панели сегментированных структур левой, правой или средней кнопкой мыши. Для дальнейшей работы с инструментом используйте ту кнопку, которой был активирован инструмент. Подробнее об управлении инструментами см. в разделе 1.14. Удерживая нажатой кнопку мыши, которой был активирован инструмент, перемещайте поверхность в плоскости экрана.

Рис. 6.17: Импортированная поверхность

Для масштабирования поверхности перемещайте вверх-вниз мышь с нажатой кнопкой, которой был активирован инструмент, удерживая клавишу Ctrl.

Для вращения поверхности относительно её центра перемещайте мышь с нажатой кнопкой, которой был активирован инструмент, удерживая клавишу Alt.

Для создания сегментной структуры по поверхности наведите курсор мыши на импортированную поверхность в списке сегментированных структур, щёлкните правой кнопкой мыши и выберите в контекстном меню пункт «Создать маску по поверхности».

6.7.3 Экспорт структуры в текущее исследование

____________________________________________________________________________________________

Функциональность доступна в дополнительном модуле, который активируется в редакции «Pro» за отдельную плату
____________________________________________________________________________________________

DICOM-Просмотрщик позволяет экспортировать маски сегментированных структур в текущее исследование в виде новой серии или в виде DICOM RT Structure Set IOD.

Для экспорта маски структуры в текущее исследование в виде новой серии выполните:

Выделите маску структуры на панели сегментированных структур.
Экспортируйте маску структуры в текущее исследование одним из способов:
- нажмите на кнопку «Экспорт» на панели сегментированных структур и в выпадающем меню выберите пункт «Экспорт маски в виде новой серии»;
- наведите курсор мыши на структуру в списке, маску которой нужно экспортировать, щёлкните правой кнопкой мыши, выберите в контекстном меню пункт «Экспорт» и в выпадающем меню выберите пункт «Экспорт маски в виде новой серии».

Экспортированная маска структуры сохраняется в локальное хранилище в виде новой серии текущего исследования. Миниатюра новой серии добавляется к текущим на панели серий.

Экспортированная маска структуры может быть открыта во вкладке просмотра плоских изображений, объёмной реконструкции или МПР-реконструкции.

Положение срезов в новой серии соответствует выделенному окну в момент применения команды «Экспорт маски в виде новой серии». Если было выделено окно «3D представление», то положение плоскостей будет соответствовать положению срезов в окне «Аксиальная плоскость».

6.7.4 Экспорт структуры в DICOM RT

Чтобы экспортировать маску сегментированной структуры в DICOM RT, выполните:

На панели сегментированных структур выделите структуру, маску которой нужно экспортировать в DICOM RT.

Вызовите выпадающее меню с вариантами экспорта (рис. 6.18) одним из двух способов:

нажмите на кнопку «Экспорт» на панели сегментированных структур и в выпадающем меню выберите тип экспорта в DICOM RT;

наведите курсор мыши на структуру, маску которой нужно экспортировать, щёлкните правой кнопкой мыши, выберите в контекстном меню пункт «Экспорт» и в выпадающем меню выберите тип экспорта в DICOM RT.

Рис. 6.18: Меню экспорта

Доступно три варианта экспорта маски в DICOM RT:

«Экспорт выделенной маски в DICOM RT...». Экспортируется только маска текущей выделенной структуры;

«Экспорт видимых масок в DICOM RT». Экспортируются все видимые маски структур, для которых включена видимость на панели сегментированных структур;

«Экспорт всех масок в DICOM RT». Экспортируются все маски структур из панели сегментированных структур.

В открывшемся диалоговом окне «Экспорт в DICOM RT» (рис. 6.19) добавьте описание экспортируемой RTSTRUCT-серии. По умолчанию описание серии «Сегментация».

Рис. 6.19: Диалог экспорта сегментированных структур в DICOM RT

Нажмите «OK», чтобы экспортировать маску структуры, или «ОТМЕНА» для отмены.

Экспортированная маска структуры сохраняется в локальное хранилище в виде новой серии с модальностью «RTSTRUCT». Миниатюра новой серии добавляется к текущим на панели серий.

Если серия многофазная, то маска структуры экспортируется только для текущей фазы. Если при экспорте ни одна маска не была экспортирована, например, под маской редактирования не виден ни один воксель, выводится сообщение об ошибке экспорта.

6.7.5 Импорт структуры из DICOM RT

Импорт маски сегментированной структуры из DICOM RT может быть выполнен двумя способами:

нажмите на кнопку «Импорт масок из DICOM RT...» на панели сегментированных структур;
наведите курсор мыши на структуру в списке, маску которой нужно импортировать, щёлкните правой кнопкой мыши, выберите в контекстном меню пункт «Импорт» и в выпадающем меню выберите пункт «Импорт масок из DICOM RT...».

В диалоговом окне «Импорт из DICOM RT» (рис. 6.20) выберите структуру, маску которой нужно импортировать, установив переключатель возле имени структуры.

Рис. 6.20: Диалог импорта масок из DICOM RT

Нажмите «OK», чтобы импортировать маску структуры, или «ОТМЕНА» для отмены.

В блоке «Структуры для импорта» диалогового окна (рис. 6.21) установите флаг возле структуры, маску которой желаете импортировать. Чтобы импортировать все маски из списка, установите флаг в верхнем поле. По умолчанию флаги не установлены.

Из выпадающего списка «Интерполяция» в блоке «Вокселизация» выберите вариант интерполяции для сегментации по контурам. Возможные варианты интерполяции:

Линейная;
Эрмитовым сплайном (установлена по умолчанию).

Выбранный вариант интерполяции отображается при последующем открытии диалога выбора структур.

Рис. 6.21: Диалог выбора масок структур

Нажмите «OK», чтобы импортировать маску структуры, или «ОТМЕНА» для отмены.